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食品科學與技術國家重點實驗室是在原江南大學食品科學與安全和南昌大學食品科學兩個教育部重點實驗室的基礎上建立起來的國內食品科學領域第一個國家重點實驗室。2007年9月通過專家論證，2007年10月由科技部批準建設，以良好成績順利通過了2011年和2016年兩次科技部組織的國家重點實驗室評估。實驗室主任為江南大學原副校長金征宇教授，孫寶國院士任學術委員會主任。

實驗室圍繞食品科學與技術領域基礎和應用基礎性的國際研究前沿，根據我國食品工業的發展需要，確定在食品加工與組分變化、食品安全性檢測與控制、食品配料與添加劑的生物制造、食品加工新技術原理及應用四個方面展開研究，立足食品與人體健康的相關性研究，逐步構建食品加工過程控制新理論與新方法體系，從而達到控制食品及配料的品質，消除不安全因素，增進人體健康。實驗室籌建以來，根據自身學科發展的優勢和特色，積極投身國家經濟建設和社會發展主戰場，參加和承擔了一大批基礎、應用基礎和關鍵技術攻關項目以及科技成果轉化型項目。

食品科學與技術國家重點實驗室在集中最優勢人才資源的基礎上，進一步向海內外招聘優秀人才，目前形成以中國工程院院士、國家“杰青”獲得者、國家重點學科帶頭人以及教育部創新團隊負責人為學術方向帶頭人、一批年富力強的中青年學術骨干、年青的海外留學歸國博士為中堅力量的研究隊伍。

實驗室擁有透射電子顯微鏡、液相色譜串聯四級飛行時間質譜聯用儀、全數字化核磁共振波譜儀、氣相色譜串聯質譜聯用儀、液相色譜-質譜聯用儀、離子色譜儀、微射流均質機、流式細胞儀等先進儀器設備2000余臺套，總價值7000余萬元，建有公共測試平臺、食品生物技術等公用研究平臺，服務方向是食品、生物、發酵、農業、環境、醫藥、化工等行業有機化合物的定性、定量和結構分析及元素分析等。

實驗室實行主任負責制，按照“開放、流動、聯合、競爭”的原則，以“優勢學科聯合、優秀人才集中、包容整合”的建室思想，實施邊建設、邊開放的管理運行模式。實驗室的目標是經過幾年的運行，建成一個與國際接軌的、體現國內最高水平的食品科學與技術研究中心和開放性平臺，成為組織高水平基礎研究和應用基礎研究、聚集和培養優秀科學家、開展學術交流的重要基地。

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